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タイトル: Searching slgnal transduction pathways in protein-protein interaction networks
その他のタイトル: タンパク質間相互作用ネットワークからシグナル伝達パスウェイを検出する手法の開発
著者: 岡, 弘之
著者(別言語): Oka, Hiroyuki
キーワード: slgnal transduction pathways
protein-protein interaction networks
発行日: 2005年
抄録: We developed a new method to searchfunctionally similar protein interaction networks witha glVen query Slgnal transduction pathway from protein interaction networks.This method consists of two main parts: 1)a backtracking search algorithm to find topologically identical subgraphs and 2) a measurement of similaritybetween proteins by using Gene Ontology [1]. For validation of our method, we implemented a software tool and compared its performancewiththat of PathBLAST [2] onthe search of MAPK signal transduction cascade[3]. The result showed that our software tool detects correct answers with low false-positive rate. This tool wi11 provide better performance when combined with computational method of predicting proteinfunctions.
内容記述: 報告番号: ; 学位授与年月日: 2005-03- ; 学位の種別: 修士 ; 学位の種類: 修士() ; 学位記番号: ; 研究科・専攻: 新領域創成科学研究科情報生命科学専攻
URI: http://hdl.handle.net/2261/2273
出現カテゴリ:1224125 修士論文(情報生命科学専攻)
025 修士論文


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