WEKO3
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芳香環二水酸化酵素の電子伝達機構の解明
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名前 / ファイル | ライセンス | アクション |
---|---|---|
39-097032.pdf (12.5 MB)
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|
Item type | 学位論文 / Thesis or Dissertation(1) | |||||
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公開日 | 2014-02-24 | |||||
タイトル | ||||||
タイトル | 芳香環二水酸化酵素の電子伝達機構の解明 | |||||
言語 | ||||||
言語 | jpn | |||||
資源タイプ | ||||||
資源 | http://purl.org/coar/resource_type/c_46ec | |||||
タイプ | thesis | |||||
ID登録 | ||||||
ID登録 | 10.15083/00005555 | |||||
ID登録タイプ | JaLC | |||||
著者 |
梅田, 隆志
× 梅田, 隆志 |
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著者別名 | ||||||
識別子 | 11586 | |||||
識別子Scheme | WEKO | |||||
姓名 | ウメダ, タカシ | |||||
著者所属 | ||||||
著者所属 | 東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命工学専攻 | |||||
Abstract | ||||||
内容記述タイプ | Abstract | |||||
内容記述 | Carbazole 1, 9a-dioxygenase (CARDO)は, 細菌によるカルバゾール(CAR)分解の初発酸化酵素であり, CARの1位及び9a位の炭素に対する二原子酸素添加反応を触媒する. CARDOは実際に水酸化反応を触媒するoxygenase (Oxy)と, NADHからの電子をOxyに伝達するferredoxin reductase (Red), ferredoxin (Fd)の三つのコンポーネントから構成される. CARDOはOxyが非ヘム鉄及びRieske型[2Fe-2S]クラスタを持つことから, Rieske non-heme iron oxygenase (RO)という酸化酵素群に属する. ROは電子伝達系の数と種類の違いにより, IA, IB, IIA, IIB, IIIの5つのクラスに分類される. 当研究室では, CAR資化菌としてNovosphingobium sp. KA1株, Nocardioides aromaticivorans IC177株, Pseudomonas resinovorans CA10株を単離しているが, それらに由来するCARDOは, Oxyが互いに高い相同性を示し(一次配列で>44% identity, >75% similarity), かつ同一の化合物を主要な基質としているにも関わらず, FdとRedの特徴の違いからそれぞれクラスIIA, IIB, IIIに分類される. 主要な基質が同一なROにおいて電子伝達系に多様性がある例は他になく, CARDOはROの電子伝達機構を明らかにする上で格好の材料であると言える. また, 以前の電子伝達系の互換性の解析から, CARDOにおいては, Oxy-Fd間の認識は厳密で異なるクラスの組み合わせだと電子が伝達されない一方, Fd-Red間の選択性が低くクラスの異なる組み合わせでも電子が伝達されることが明らかになったが, これは他のROと同様の傾向であった. しかし興味深いことに, KA1株由来Fdは特異的に他のクラスのRedからは電子を受け取ることが出来ない. すなわち, クラスIIA型Fdは電子伝達のカウンターパートとの認識が厳密であるという他にない特徴を持つことが明らかとなっていた. 本研究では, CARDOコンポーネントの結晶構造解析, コンポーネント間相互作用の親和性の解析を行うことにより, ROに普遍的なコンポーネント間相互作用の分子メカニズムを明らかすること, また, クラスIIA CARDOの例外的な相互作用メカニズムを詳らかにすることを目的とした. | |||||
書誌情報 | 発行日 2012-03-22 | |||||
日本十進分類法 | ||||||
主題 | 464 | |||||
主題Scheme | NDC | |||||
学位名 | ||||||
学位名 | 博士(農学) | |||||
学位 | ||||||
値 | doctoral | |||||
学位分野 | ||||||
Agriculture (農学) | ||||||
学位授与機関 | ||||||
学位授与機関名 | University of Tokyo (東京大学) | |||||
研究科・専攻 | ||||||
Department of Biotechnology, Graduate School of Agricultural and Life Sciences (農学生命科学研究科応用生命工学専攻) | ||||||
学位授与年月日 | ||||||
学位授与年月日 | 2012-03-22 | |||||
学位授与番号 | ||||||
学位授与番号 | 甲第28051号 | |||||
学位記番号 | ||||||
博農第3767号 |